Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms