Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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