Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms