Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac7Q8C2B3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac7Q8C2B3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Hdac7Q8C2B3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac7Q8C2B3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac7Q8C2B3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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