Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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