Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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