Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTH8

Csnk1g1, Casein kinase I isoform gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g1Q8BTH8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1g1Q8BTH8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms