Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl16Q8BSU2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl16Q8BSU2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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