Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c2Q8BL74 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c2Q8BL74 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms