Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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