Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms