Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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