Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms