Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms