Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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