Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf7ipQ7TT18 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atf7ipQ7TT18 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms