Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms