Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrc2aQ7TSC1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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