Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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