Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LnpkQ7TQ95 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LnpkQ7TQ95 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LnpkQ7TQ95 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LnpkQ7TQ95 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LnpkQ7TQ95 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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