Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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