Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GypcQ78HU7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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