Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rph3alQ768S4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rph3alQ768S4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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