Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms