Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms