Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms