Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms