Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms