Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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