Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms