Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms