Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms