Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Fndc3c1Q6DFV6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Fndc3c1Q6DFV6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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