Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms