Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9bQ66X22 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms