Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trim28Q62318 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trim28Q62318 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trim28Q62318 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trim28Q62318 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim28Q62318 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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