Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ss18Q62280 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ss18Q62280 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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