Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms