Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms