Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd6Q61003 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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