Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms