Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mkrn3Q60764 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Mkrn3Q60764 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Mkrn3Q60764 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Mkrn3Q60764 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms