Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms