Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms