Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp20Q5XG71 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms