Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim38Q5SZ99 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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