Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms