Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trappc1Q5NCF2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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