Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms