Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms